MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halobacillus halophilus DSM 2266

Total Repeats: 70623

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017668	A	6	6	564	569	100 %	0 %	0 %	0 %	386712344
2	NC_017668	GAAT	2	8	652	659	50 %	25 %	25 %	0 %	386712344
3	NC_017668	GATT	2	8	693	700	25 %	50 %	25 %	0 %	386712344
4	NC_017668	TAT	2	6	748	753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712344
5	NC_017668	AGA	2	6	766	771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712344
6	NC_017668	GATG	2	8	775	782	25 %	25 %	50 %	0 %	386712344
7	NC_017668	AAG	2	6	800	805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712344
8	NC_017668	GAA	2	6	817	822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712344
9	NC_017668	GAA	2	6	833	838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712344
10	NC_017668	GCA	2	6	914	919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712344
11	NC_017668	TGG	2	6	973	978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712344
12	NC_017668	AC	3	6	995	1000	50 %	0 %	0 %	50 %	386712344
13	NC_017668	ATGC	2	8	1004	1011	25 %	25 %	25 %	25 %	386712344
14	NC_017668	TTTA	2	8	1056	1063	25 %	75 %	0 %	0 %	386712344
15	NC_017668	AATTC	2	10	1094	1103	40 %	40 %	0 %	20 %	386712344
16	NC_017668	TAA	2	6	1129	1134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712344
17	NC_017668	TGA	2	6	1162	1167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712344
18	NC_017668	TTC	2	6	1208	1213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712344
19	NC_017668	GCC	2	6	1270	1275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386712344
20	NC_017668	GATT	2	8	1326	1333	25 %	50 %	25 %	0 %	386712344
21	NC_017668	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386712344
22	NC_017668	GGAG	2	8	1468	1475	25 %	0 %	75 %	0 %	386712344
23	NC_017668	GA	3	6	1614	1619	50 %	0 %	50 %	0 %	386712344
24	NC_017668	TTAGA	2	10	1629	1638	40 %	40 %	20 %	0 %	386712344
25	NC_017668	GAA	2	6	1651	1656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712344
26	NC_017668	TATC	2	8	1697	1704	25 %	50 %	0 %	25 %	386712344
27	NC_017668	AG	3	6	1706	1711	50 %	0 %	50 %	0 %	386712344
28	NC_017668	GAA	2	6	1742	1747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712344
29	NC_017668	GGA	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386712344
30	NC_017668	CAG	2	6	1817	1822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712344
31	NC_017668	AGC	2	6	1851	1856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712344
32	NC_017668	AACGT	2	10	1861	1870	40 %	20 %	20 %	20 %	386712344
33	NC_017668	TCA	2	6	2107	2112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712345
34	NC_017668	AAG	3	9	2219	2227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712345
35	NC_017668	TCGT	2	8	2297	2304	0 %	50 %	25 %	25 %	386712345
36	NC_017668	TTGAAA	2	12	2324	2335	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386712345
37	NC_017668	GAA	2	6	2404	2409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712345
38	NC_017668	TTA	2	6	2464	2469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712345
39	NC_017668	GTC	2	6	2647	2652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712345
40	NC_017668	AACTG	2	10	2670	2679	40 %	20 %	20 %	20 %	386712345
41	NC_017668	TGA	2	6	2691	2696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712345
42	NC_017668	AGA	2	6	2700	2705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712345
43	NC_017668	AAGT	2	8	2714	2721	50 %	25 %	25 %	0 %	386712345
44	NC_017668	CTT	2	6	2763	2768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712345
45	NC_017668	CT	3	6	2880	2885	0 %	50 %	0 %	50 %	386712345
46	NC_017668	TAA	2	6	2904	2909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712345
47	NC_017668	CGT	2	6	2910	2915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712345
48	NC_017668	GAAA	2	8	2928	2935	75 %	0 %	25 %	0 %	386712345
49	NC_017668	ACC	2	6	2939	2944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386712345
50	NC_017668	GAA	2	6	2986	2991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712345
51	NC_017668	CAG	2	6	2996	3001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712345
52	NC_017668	AT	3	6	3045	3050	50 %	50 %	0 %	0 %	386712345
53	NC_017668	GATG	2	8	3051	3058	25 %	25 %	50 %	0 %	386712345
54	NC_017668	CCTG	2	8	3162	3169	0 %	25 %	25 %	50 %	386712345
55	NC_017668	AT	3	6	3415	3420	50 %	50 %	0 %	0 %	386712346
56	NC_017668	TGG	2	6	3463	3468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712346
57	NC_017668	ATT	2	6	3478	3483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712346
58	NC_017668	CGT	2	6	3527	3532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712346
59	NC_017668	AGA	2	6	3568	3573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712346
60	NC_017668	GAA	2	6	3599	3604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712346
61	NC_017668	ATT	2	6	3708	3713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712347
62	NC_017668	TAAAA	2	10	3830	3839	80 %	20 %	0 %	0 %	386712347
63	NC_017668	A	6	6	3900	3905	100 %	0 %	0 %	0 %	386712347
64	NC_017668	CGT	2	6	4017	4022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712347
65	NC_017668	TATC	2	8	4064	4071	25 %	50 %	0 %	25 %	386712347
66	NC_017668	TCC	2	6	4093	4098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386712347
67	NC_017668	CTG	2	6	4113	4118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712347
68	NC_017668	CGA	2	6	4195	4200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712347
69	NC_017668	GCT	2	6	4229	4234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712347
70	NC_017668	GAT	2	6	4428	4433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712347
71	NC_017668	CAG	2	6	4485	4490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712347
72	NC_017668	AAC	2	6	4493	4498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386712347
73	NC_017668	TCAT	2	8	4531	4538	25 %	50 %	0 %	25 %	386712347
74	NC_017668	CTT	2	6	4563	4568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712347
75	NC_017668	GAT	2	6	4572	4577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712347
76	NC_017668	TTCA	2	8	4758	4765	25 %	50 %	0 %	25 %	386712348
77	NC_017668	TGA	2	6	4825	4830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712348
78	NC_017668	TAT	2	6	4841	4846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712348
79	NC_017668	GTG	2	6	4884	4889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712348
80	NC_017668	AGA	3	9	4895	4903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712348
81	NC_017668	TA	4	8	4935	4942	50 %	50 %	0 %	0 %	386712348
82	NC_017668	AGA	2	6	4972	4977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712348
83	NC_017668	TAAA	2	8	4999	5006	75 %	25 %	0 %	0 %	386712348
84	NC_017668	AGA	2	6	5021	5026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712348
85	NC_017668	GAAG	2	8	5103	5110	50 %	0 %	50 %	0 %	386712349
86	NC_017668	ATG	2	6	5132	5137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712349
87	NC_017668	CGA	2	6	5204	5209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712349
88	NC_017668	CAC	2	6	5224	5229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386712349
89	NC_017668	TGA	2	6	5297	5302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712349
90	NC_017668	TTC	2	6	5405	5410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712349
91	NC_017668	GGA	3	9	5428	5436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386712349
92	NC_017668	GGA	2	6	5452	5457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386712349
93	NC_017668	ATC	2	6	5493	5498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712349
94	NC_017668	GAA	2	6	5566	5571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712349
95	NC_017668	GCTT	2	8	5694	5701	0 %	50 %	25 %	25 %	386712349
96	NC_017668	TAT	3	9	5764	5772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712349
97	NC_017668	GA	3	6	5814	5819	50 %	0 %	50 %	0 %	386712349
98	NC_017668	ATG	2	6	5891	5896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712349
99	NC_017668	AAT	2	6	5926	5931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712349
100	NC_017668	TACG	2	8	5937	5944	25 %	25 %	25 %	25 %	386712349
101	NC_017668	AC	3	6	5953	5958	50 %	0 %	0 %	50 %	386712349
102	NC_017668	ACTC	2	8	5979	5986	25 %	25 %	0 %	50 %	386712349
103	NC_017668	ATA	2	6	6014	6019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712349
104	NC_017668	GAT	2	6	6052	6057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712349
105	NC_017668	TAT	2	6	6078	6083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712349
106	NC_017668	GACA	2	8	6116	6123	50 %	0 %	25 %	25 %	386712349
107	NC_017668	AAAG	2	8	6270	6277	75 %	0 %	25 %	0 %	386712349
108	NC_017668	GGA	2	6	6400	6405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386712349
109	NC_017668	TTC	2	6	6443	6448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712349
110	NC_017668	ATT	2	6	6463	6468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712349
111	NC_017668	AAT	2	6	6505	6510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712349
112	NC_017668	ATT	2	6	6523	6528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712349
113	NC_017668	CTT	2	6	6637	6642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712349
114	NC_017668	CTT	2	6	6648	6653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712349
115	NC_017668	TTGA	2	8	6673	6680	25 %	50 %	25 %	0 %	386712349
116	NC_017668	GCC	2	6	6705	6710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386712349
117	NC_017668	TAT	2	6	6742	6747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712349
118	NC_017668	AGC	2	6	6761	6766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712349
119	NC_017668	GA	3	6	6833	6838	50 %	0 %	50 %	0 %	386712349
120	NC_017668	AAC	2	6	6848	6853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386712349
121	NC_017668	GCT	2	6	6888	6893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712349
122	NC_017668	TGG	2	6	7128	7133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712350
123	NC_017668	TCCT	2	8	7190	7197	0 %	50 %	0 %	50 %	386712350
124	NC_017668	TGCCT	2	10	7228	7237	0 %	40 %	20 %	40 %	386712350
125	NC_017668	CCG	2	6	7267	7272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386712350
126	NC_017668	ATGCA	2	10	7281	7290	40 %	20 %	20 %	20 %	386712350
127	NC_017668	GCAT	2	8	7299	7306	25 %	25 %	25 %	25 %	386712350
128	NC_017668	A	6	6	7322	7327	100 %	0 %	0 %	0 %	386712350
129	NC_017668	TACGA	2	10	7388	7397	40 %	20 %	20 %	20 %	386712350
130	NC_017668	GGAC	2	8	7441	7448	25 %	0 %	50 %	25 %	386712350
131	NC_017668	CGC	2	6	7477	7482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386712350
132	NC_017668	ATG	2	6	7566	7571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712350
133	NC_017668	GGT	2	6	7640	7645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712350
134	NC_017668	TCC	2	6	7678	7683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386712350
135	NC_017668	TCA	2	6	7684	7689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712350
136	NC_017668	GAA	2	6	7880	7885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712350
137	NC_017668	A	7	7	7982	7988	100 %	0 %	0 %	0 %	386712350
138	NC_017668	CGT	2	6	8038	8043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712350
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141	NC_017668	AGAA	2	8	8205	8212	75 %	0 %	25 %	0 %	386712350
142	NC_017668	TCA	2	6	8214	8219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712350
143	NC_017668	TGA	2	6	8509	8514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712350
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157	NC_017668	TCG	2	6	8952	8957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712350
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162	NC_017668	GAC	2	6	9068	9073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712350
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167	NC_017668	GAA	2	6	9524	9529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712350
168	NC_017668	AGA	4	12	9562	9573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712350
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172	NC_017668	GAA	2	6	9653	9658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712350
173	NC_017668	TAA	2	6	9819	9824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712351
174	NC_017668	AAG	2	6	9905	9910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712351
175	NC_017668	AAC	2	6	9972	9977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386712351
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255	NC_017668	GTCA	2	8	15381	15388	25 %	25 %	25 %	25 %	386712355
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262	NC_017668	TGC	2	6	15749	15754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712355
263	NC_017668	AATA	2	8	15781	15788	75 %	25 %	0 %	0 %	386712355
264	NC_017668	CAT	2	6	15882	15887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712356
265	NC_017668	ATT	2	6	16012	16017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712356
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267	NC_017668	CAC	2	6	16032	16037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386712356
268	NC_017668	TTCC	2	8	16386	16393	0 %	50 %	0 %	50 %	386712356
269	NC_017668	ATC	2	6	16412	16417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712356
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285	NC_017668	GCT	2	6	17782	17787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712357
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384	NC_017668	AAAGC	2	10	26050	26059	60 %	0 %	20 %	20 %	386712366
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386	NC_017668	AAAT	2	8	26084	26091	75 %	25 %	0 %	0 %	386712366
387	NC_017668	GAA	2	6	26169	26174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712366
388	NC_017668	GGC	2	6	26226	26231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386712366
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